Agaroz tozuc24h38o19 kimyasal formülüne sahip organik bir maddedir. Doğrusal bir polimer olan beyaz veya sarı boncuk benzeri jel parçacığı veya tozdur ve temel yapısı 1,3 bağlantılı - D-galaktoz ve 1,4-bağlı 3,6-endoeter-l-galaktoz dönüşümlü olarak bağlanır.
Agar pektini birçok küçük molekülden oluşan heterojen bir karışımdır. Agaroz, suda çözünmesi için genellikle 90 derecenin üzerine ısıtılır ve sıcaklık 35-40 dereceye düştüğünde, ana özelliği ve çeşitli kullanımlarının temeli olan iyi bir yarı katı jel oluşturur. Agaroz jelin performansı genellikle jelin gücüyle ifade edilir. Mukavemet ne kadar yüksek olursa jelin performansı da o kadar iyi olur.
Agaroz tozukırmızı alglerin polisakkaritlerinden türetilir ve ana bileşeni çoğunlukla laktozdur; bunun yaklaşık %70'i agaroz ve %30'u dallı zincirli agarozdur.
Agaroz, dönüşümlü olarak D-galaktoz ve 3,6-dehidre galaktoz beta-1,4 ve alfa-1,3 tarafından oluşturulan tekrarlanan disakkarit birimleriyle doğrusal bir yapıya sahiptir.
Başka bir zinciri ayıran üç bağ ile dallanmış agarozu -1'den çıkarın. Deniz yosunundan sıcak su ile ekstrakte edilen madde yaklaşık %40 oranında agar içerir.
Ticari agar (genellikle agar olarak anılır) genellikle ince tabakalar veya gevşek ipler şeklindedir ve genellikle yenilebilir sakız, ilaç paketleme maddesi veya bakteri kültürü ortamı olarak kullanılır.
Saf agaroz genellikle biyokimya laboratuvarlarında elektroforez, kromatografi ve diğer teknikler ile biyomoleküllerin veya küçük moleküllerin ayrılması ve analizi için yarı{0}}katı bir destek olarak kullanılır.
Agaroz Tozudeniz yosunundan elde edilen bir polisakkarittir ve agarın ana bileşenidir. Keşfinden bu yana jel oluşturma yeteneği, termal stabilite, kimyasal stabilite ve biyouyumluluk gibi benzersiz fiziksel ve kimyasal özelliklerinden dolayı birçok alanda yaygın olarak kullanılmaktadır. Aşağıda amacının ayrıntılı bir açıklaması bulunmaktadır:
Biyomedikal Araştırmalarda Uygulama
Agaroz jel elektroforezi moleküler biyolojide en yaygın kullanılan ayırma ve analiz tekniklerinden biridir. Jel elektroforez ortamı olarak agaroz, büyük gözenek boyutu, geniş ayırma aralığı ve basit operasyon avantajlarına sahiptir. Elektroforez sürecinde DNA, RNA veya protein gibi biyolojik makromoleküller, elektrik alanının etkisi altında agaroz jelin gözenekleri boyunca göç eder. Farklı moleküllerin yük, boyut ve şekillerindeki farklılıklar nedeniyle jeldeki göç hızları farklıdır, dolayısıyla ayırma sağlanır.
Agaroz jel elektroforezi, gen klonlama, gen ekspresyon analizi ve gen mutasyon tespitinde yaygın olarak kullanılmaktadır. Hücre kültüründe yaygın olarak destek veya matris olarak kullanılır. Mükemmel biyouyumluluğu ve kimyasal stabilitesi nedeniyle agaroz, hücreler için stabil bir büyüme ortamı sağlayabilir. Örneğin, yumuşak agar koloni oluşumu deneyinde, hücrelerin kötü huylu dönüşüm derecesinin değerlendirilmesi açısından büyük önem taşıyan, hücrelerin koloni oluşturma yeteneğini tespit etmek amacıyla yarı-katı kültür ortamı hazırlamak için agaroz kullanılır.
Ek olarak agaroz, doku mühendisliği ve rejeneratif tıpta kullanılmak üzere kompozit iskele malzemeleri hazırlamak için diğer biyomateryallerle de birleştirilebilir. Agaroz jel ayrıca immün difüzyon ve immün elektroforezde de önemli bir rol oynar. Bu teknolojilerde, antijen ve antikor reaksiyonunun ortamı olarak agaroz jel, antijen veya antikorun varlığını ve konsantrasyonunu tespit etmek ve analiz etmek için kullanılabilen net çökelme çizgileri veya halkaları oluşturabilir. Agaroz jelin gözenek boyutu ve yük özelliği, antijen ve antikorun difüzyon hızını ve bağlanma etkinliğini etkileyebilir, dolayısıyla agarozun konsantrasyonu ve türü ayarlanarak deney koşulları optimize edilebilir.
Moleküler Biyoloji Deneylerinde Uygulama
Agaroz jel elektroforezi yalnızca DNA ve RNA'yı ayırmak için kullanılamaz, aynı zamanda bunların saflaştırılmasını sağlamak için diğer teknolojilerle birleştirilebilir. Örneğin, DNA ekstraksiyonu sürecinde, DNA'nın bütünlüğünü ve saflığını tespit etmek için agaroz jel elektroforezi kullanılabilir ve daha sonra hedef DNA segmenti, jel kesme ve geri kazanım yoluyla jelden ayrılabilir. Bu yöntemin kolay kullanım ve yüksek iyileşme oranı gibi avantajları vardır. Nükleik asit hibridizasyon deneylerinde, DNA veya RNA problarını jel üzerinde sabitlemek ve daha sonra etiketli hedef nükleik asit ile hibridize etmek için agaroz jel, katı faz desteği olarak kullanılabilir.
Hibridizasyon sinyallerinin varlığının ve yoğunluğunun tespit edilmesiyle hedef nükleik asitlerin varlığı ve konsantrasyonu belirlenebilir. Agaroz jelin gözenek boyutu ve yük özelliği, prob ve hedef nükleik asidin bağlanma verimliliğini etkileyebilir, dolayısıyla hibridizasyon koşulları, agaroz konsantrasyonu ve tipi ayarlanarak optimize edilebilir. Polimeraz zincir reaksiyonu (PCR), DNA amplifikasyonu için moleküler biyolojide en yaygın kullanılan tekniklerden biridir. PCR ürünlerinin analizinde agaroz jel elektroforezi en sık kullanılan yöntemlerden biridir. PCR ürünlerini elektroforez yoluyla ayırarak, çoğaltılmış parçaların boyutu ve saflığı tespit edilebilir, böylece PCR reaksiyonunun başarılı olup olmadığı ve-spesifik olmayan amplifikasyon sorunlarının olup olmadığı belirlenebilir.
Biyokimyasal Analizde Uygulama
Agaroz jelin gözenek boyutu nispeten büyük olmasına rağmen küçük moleküler proteinlerin ayrılması için uygun değildir ancak yine de bazı durumlarda protein ayrımı ve saflaştırılması için kullanılabilir. Örneğin, hazırlayıcı jel elektroforezinde, daha büyük moleküler ağırlığa sahip proteinleri ayırmak ve saflaştırmak için agaroz jel kullanılabilir.
Ek olarak agaroz, ayırma aralığını genişletmek ve ayırma verimliliğini artırmak için kompozit jel hazırlamak üzere diğer malzemelerle de birleştirilebilir. Bazı enzim aktivite belirleme deneylerinde, enzim immobilizasyonu için taşıyıcı olarak agaroz jeli kullanılabilmektedir. Enzimin agaroz jel üzerinde immobilizasyonu, enzimin aktivitesini ve stabilitesini koruyabilir ve enzimin reaktanlardan ayrılmasını ve geri kazanılmasını kolaylaştırabilir. Bu yöntemin enzim mühendisliği alanında geniş uygulamaları vardır.
Mikrobiyolojide Uygulama
Agaroz, mikrobiyal kültür ortamlarında pıhtılaştırıcı olarak yaygın olarak kullanılır. Agar ile karşılaştırıldığında agarozun saflığı daha yüksek ve safsızlık içeriği daha düşüktür, bu da onu mikrobiyal ekim için daha uygun hale getirir. Katı kültür ortamını hazırlarken agarozu sıcak suda çözün, ardından diğer besinleri ve antibiyotikleri ekleyin ve katı kültür ortamını oluşturmak için soğutun.
Bu tür kültür ortamı, mikroorganizmalar için stabil bir büyüme ortamı sağlayarak onların izolasyonunu, saflaştırılmasını ve tanımlanmasını kolaylaştırabilir. Mikrobiyolojik tanımlama deneylerinde özel tanımlama ortamı hazırlamak için agaroz jel kullanılabilir. Örneğin, bağırsak bakterilerini tanımlarken, şeker fermantasyonlarını gözlemleyerek farklı bakteri türlerini ayırt etmek için spesifik şekerler içeren agaroz kültür ortamı kullanılabilir. Ayrıca agaroz jel, mikroorganizmaların metabolik özelliklerini ve enzim aktivitelerini tespit etmek amacıyla biyokimyasal reaksiyon ortamı hazırlamak için de kullanılabilir.
Agaroz üretim süreci dört bölüme ayrılabilir: ön arıtma, ekstraksiyon, DEAE selüloz arıtması ve dehidrasyon.
Ön işleme tabi tutulan toz halindeki ham maddeler 80°C'de 1/2 saat süreyle doğrudan kurutulur. şerit ve blok hammaddeleri su ile yıkanır, küçük parçalar halinde kesilir ve fırınlanır.
Ekstraksiyon: karıştırdıktan ve asetik asit sodyum asetat karışık ester solüsyonuyla birkaç saat ekstrakte ettikten sonra, suyu emerek çıkarın, yıkayın, ardından karıştırın ve birkaç saat boyunca sodyum karbonat sodyum bikarbonat tampon solüsyonu ile ekstrakte edin ve ardından pompalayın, filtreleyin ve suyla yıkayın.
Tampon çözelti ile ekstrakte edilen agar jeli, su ile ısıtılarak %4'lük çözelti içerisinde çözündürüldükten sonra DEAE selüloz ilave edilerek ısı koruması altında 3-4 saat karıştırıldıktan sonra santrifüj edilir. Süzüntü toplanır ve kolloidal durumda beyaz bir çözelti elde etmek üzere süzülür.
Dehidrasyon: Beyaz süzüntüyü ısıttıktan sonra, belirgin bir çökelti kalmayana kadar karıştırarak hızla %95 etanol ekleyin, oda sıcaklığına soğutun, üst katman çözeltisini dökün, %71 verimle ürünü elde etmek için çökeltiyi yıkayın ve kurutun.
Reaktif geri kazanımı DEAE selüloz geri kazanımı: Santrifüjlemeden sonra çökelti su ile kaynatılır, 100 gözenekli ipek kumaş üzerinde filtrelenir, filtrat berraklaşana kadar birkaç kez tekrarlanır, ardından 0,5mol/1 HCI, 0,5mol/1 NaOH ve su ile yıkanır ve kurutulur. Geri kazanım oranı %95'tir. 80 C fraksiyonu, Yichun sulu çözeltisinden geri kazanılan etanolik sulu çözeltinin doğrudan damıtılmasıyla toplandı. Daha sonra doygunluğa kadar katı sodyum klorür ekleyin ve %. 70 damıtmaya devam edin. Şişedeki sodyum klorür buharlaştırıldıktan sonra vana ile de doldurulabilir.
Agaroz tozuSuda çözünmesi için genellikle 90 derece C'nin üzerine ısıtılır. Sıcaklık 35-40 derece C'ye düştüğünde iyi bir yarı katı jel oluşturacaktır; bu aynı zamanda ana özelliği ve çeşitli kullanımların temelidir. Agaroz jelin performansı genellikle jelin gücüyle ifade edilir. Konsantrasyon ne kadar yüksek olursa jelin etkisi o kadar iyi olur. Agaroz jeli hidrojen bağının varlığından kaynaklanır. Hidrojen bağını bozabilecek herhangi bir faktör jelin tahrip olmasına neden olabilir. Agaroz hidrofiliktir ve neredeyse tamamen yüklü gruplardan arındırılmıştır. Nadiren denatürasyona ve hassas biyomoleküllerin adsorpsiyonuna neden olur. İdeal bir inert taşıyıcıdır.
Agarozun hazırlanması sırasında agaroz pektinin mümkün olduğunca uzaklaştırılması gerekir, aksi takdirde agarozdaki iyonize grupların yerini alan çok az miktarda sülfat ve piruvat olabilir, bu da elektroozmoza (EEO) yol açabilir ve parçacık hareketini etkileyebilir. Yüksek-kaliteli agarozun sülfat içeriği nispeten düşüktür, genellikle %0,2'nin altındadır ve elektroozmotik etkisi nispeten küçüktür, genellikle 0,13'ün altındadır. Bu yüzden agar agardan çok daha pahalıdır.
1937'de Araki ilk olarak agarı agardan izole etti.
Hjertin'in agarozun mükemmel özelliklerini ilk kez keşfetmesi ancak 1961 yılına kadar mümkün olmadı; bu durum giderek daha fazla ilgi gördü ve endüstriyel üretime başladı. Agaroz klinik testlerde, biyokimyasal analizlerde ve biyomoleküllerin ayrılmasında yaygın olarak kullanılır.
Agaroz tozu moleküler biyoloji ve biyoteknolojide temel bir araçtır. Jel elektroforezi, afinite kromatografisi, immünodifüzyon, immünelektroforez ve diğer alanlarda yaygın olarak kullanılmaktadır.
Kullanım kolaylığı, çok işlevlilik, düşük toksisite ve maliyet-etkinliği gibi benzersiz özellikleri, onu laboratuvar araştırmalarında vazgeçilmez bir bileşen haline getirmektedir.
Sınırlı çözünürlük ve kırılganlık sınırlamalarına rağmen, yüksek-çözünürlüklü jel, prefabrik jel ve agar bazlı mikroakışkan cihazlar dahil olmak üzere agar jel teknolojisindeki en son gelişmeler, bunların pratikliğini genişletmiş ve performanslarını iyileştirmiştir.
Bilimsel araştırmaların sürekli ilerlemesiyle birlikte, agaroz tozu şüphesiz moleküler biyoloji ve biyoteknolojinin araç kutusunda değerli ve temel bir reaktif olmaya devam edecektir.
SSS
Agaroz nedir ve amacı nedir?
Agaroz jel elektroforezinin nükleik asitleri ayırmanın verimli ve etkili bir yolu olduğu kanıtlanmıştır. Agarozun yüksek jel gücü, büyük DNA fragmanlarının ayrılması için düşük yüzdeli jellerin kullanılmasına olanak tanır.
Agaroz ve agar nedir?
Agaroz, deniz yosunlarından (örneğin kırmızı algler) elde edilen bir polisakkarittir ve ana bileşeni poligalaktozdur. Agar, agaroz ve agar pektinin birleşiminden oluşur ve agaroz elde etmek için saflaştırılır. Agaroz doğrusal bir polimorf iken agar pektini birçok küçük molekülün heterojen bir karışımıdır.
Agaroz anlamı nedir?
Agaroz, deniz kırmızısı alglerinden, özellikle de Rhodophyceae'nin agarositlerinden ekstrakte edilen, biyouyumluluğu ve termo-geri dönüşümlü jelleşme özellikleri nedeniyle hücresel çalışmalar ve jel elektroforezi için ideal jeller oluşturan, yüksek-moleküler-ağırlıklı bir polisakarit olarak tanımlanır.
Agaroz tozunun asıl amacı nedir?
Esas olarak jel elektroforezi için kullanılan agarozun, jel filtrasyon kromatografisi ve afinite saflaştırması gibi başka uygulamaları da vardır. En yaygın kullanımı, gözenek boyutunun agaroz konsantrasyonuna bağlı olduğu agaroz jellerinin hazırlanmasındadır.
Popüler Etiketler: agaroz tozu cas 9012-36-6, tedarikçiler, üreticiler, fabrika, toptan satış, satın al, fiyat, toplu, satılık